La NEPRU a été mise en place en 1990 à l’initiative du gouvernement namibien. En 1994, le Conseil d’administration a octroyé à la NEPRU 2,4 millions de dollars US pour financer les activités de son programme quinquennal. Pendant la première phase de financement de la part de la Fondation, 1994-2000, l’Unité a été renforcée d’un point de vue institutionnel et est devenue un think tanks politique produisant des résultats visibles pour la gestion des politiques de développement en Namibie. Lors de sa 24ème session ordinaire, en décembre 2000, le Conseil d’administration a approuvé un don de 2 millions de dollars US pour la NEPRU II.
Le but du projet est d’améliorer la recherche et l’analyse des politiques et de continuer à fournir aux décideurs une information économique de qualité.